Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM1Q2NKQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM1Q2NKQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms