Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ISXQ2M1V0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.6 ms