Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP35Q16560 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRNP35Q16560 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRNP35Q16560 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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