Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGN3Q15651 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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