Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK3Q15120 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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