Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD3Q15059 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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