Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCLAFQ15004 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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