Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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