Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM39Q14498 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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