Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPRIN1Q14444 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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