Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA4Q13772 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA4Q13772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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