Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKZF1Q13422 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms