Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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UBE2V1Q13404 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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UBE2V1Q13404 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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UBE2V1Q13404 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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UBE2V1Q13404 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2V1Q13404 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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