Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP140Q13342 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SP140Q13342 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SP140Q13342 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP140Q13342 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP140Q13342 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP140Q13342 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP140Q13342 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP140Q13342 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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SP140Q13342 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SP140Q13342 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP140Q13342 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP140Q13342 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SP140Q13342 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP140Q13342 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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