Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF1Q13291 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF1Q13291 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms