Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RESTQ13127 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RESTQ13127 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RESTQ13127 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RESTQ13127 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RESTQ13127 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RESTQ13127 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RESTQ13127 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RESTQ13127 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RESTQ13127 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RESTQ13127 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RESTQ13127 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RESTQ13127 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RESTQ13127 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RESTQ13127 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RESTQ13127 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RESTQ13127 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RESTQ13127 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RESTQ13127 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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