Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP6Q0PNE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP6Q0PNE2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP6Q0PNE2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms