Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 221.8■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 421.79■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 MTA2-207ENST00000532239 532 ntTSL 418.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 EHBP1L1-207ENST00000531106 176 ntTSL 37.53□□□□□ -1.24e-9■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 KIF2C-206ENST00000472235 480 ntTSL 29.41□□□□□ -0.94e-9■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 CCAR2-211ENST00000522599 1107 ntTSL 517.56■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 MAD1L1-213ENST00000455998 557 ntTSL 424.65■■□□□ 1.541e-10■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 MAD1L1-207ENST00000429779 555 ntTSL 423.41■■□□□ 1.341e-10■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-224ENST00000543009 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.45■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-215ENST00000537930 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.89□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-210ENST00000535838 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.82□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-227ENST00000544129 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.82□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-208ENST00000535087 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-222ENST00000541719 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-228ENST00000544238 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.31□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 NUMA1-211ENST00000535947 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.3□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 27.2
FMR1Q06787 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 27.1
FMR1Q06787 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 27.1
FMR1Q06787 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 USP34-216ENST00000487547 612 ntTSL 310.75□□□□□ -0.698e-10■■■■■ 27
FMR1Q06787 USP34-209ENST00000468703 228 ntTSL 55.93□□□□□ -1.468e-10■■■■■ 27
FMR1Q06787 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 45.52□□□□□ -1.538e-10■■■■■ 27
FMR1Q06787 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 212.98□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 211.8□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 27
FMR1Q06787 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 27
FMR1Q06787 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 27
FMR1Q06787 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 27
FMR1Q06787 UBR4-215ENST00000492606 314 ntTSL 36.44□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 27
FMR1Q06787 UBTF-208ENST00000529373 674 ntTSL 226.79■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 27
FMR1Q06787 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.875e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.284e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.155e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.144e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 SCRIB-204ENST00000525051 1685 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.115e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.084e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.884e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-212ENST00000474833 921 ntTSL 519.85■□□□□ 0.774e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.714e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.74e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-217ENST00000484181 1683 ntTSL 318.65■□□□□ 0.584e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-206ENST00000465423 582 ntTSL 418.45■□□□□ 0.544e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 CD63-205ENST00000548117 499 ntTSL 214.38□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.324e-13■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 NUP93-205ENST00000563437 762 ntTSL 212.77□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 AL138828.1-213ENST00000626605 713 ntTSL 510.92□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 GRB2-209ENST00000581959 359 ntTSL 38.6□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 319.8■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 71.3 ms