Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD51Q06609 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms