Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKCDQ05655 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms