Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD4Q01804 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD4Q01804 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms