Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL11P62913 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL11P62913 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL11P62913 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL11P62913 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL11P62913 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL11P62913 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms