Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2FP61218 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2FP61218 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms