Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSCP56915 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSCP56915 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSCP56915 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSCP56915 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSCP56915 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSCP56915 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GSCP56915 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSCP56915 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSCP56915 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSCP56915 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSCP56915 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSCP56915 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSCP56915 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSCP56915 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSCP56915 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSCP56915 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSCP56915 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms