Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF10P55107 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF10P55107 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF10P55107 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF10P55107 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF10P55107 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF10P55107 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF10P55107 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF10P55107 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF10P55107 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF10P55107 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF10P55107 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF10P55107 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF10P55107 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF10P55107 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF10P55107 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF10P55107 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF10P55107 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF10P55107 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF10P55107 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF10P55107 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF10P55107 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF10P55107 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF10P55107 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms