Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IST1P53990 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IST1P53990 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IST1P53990 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IST1P53990 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IST1P53990 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IST1P53990 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IST1P53990 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IST1P53990 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms