Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSCP53634 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTSCP53634 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTSCP53634 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSCP53634 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSCP53634 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSCP53634 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSCP53634 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSCP53634 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSCP53634 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSCP53634 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSCP53634 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSCP53634 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSCP53634 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSCP53634 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSCP53634 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms