Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC3P51654 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC3P51654 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC3P51654 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC3P51654 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC3P51654 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC3P51654 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC3P51654 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC3P51654 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC3P51654 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC3P51654 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC3P51654 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC3P51654 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC3P51654 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC3P51654 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms