Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms