Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DSG3P32926 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DSG3P32926 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG3P32926 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG3P32926 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG3P32926 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG3P32926 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG3P32926 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG3P32926 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG3P32926 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG3P32926 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG3P32926 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG3P32926 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG3P32926 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG3P32926 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG3P32926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG3P32926 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG3P32926 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG3P32926 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms