Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-FP30511 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-FP30511 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms