Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA3P25788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms