Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGFR4P22455 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGFR4P22455 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms