Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DPA1P20036 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPA1P20036 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms