Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF1P10914 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF1P10914 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF1P10914 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF1P10914 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF1P10914 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF1P10914 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF1P10914 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF1P10914 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF1P10914 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF1P10914 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF1P10914 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF1P10914 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF1P10914 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF1P10914 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms