Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP10827 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP10827 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP10827 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP10827 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THRAP10827 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THRAP10827 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP10827 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP10827 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP10827 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP10827 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP10827 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP10827 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP10827 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP10827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP10827 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THRAP10827 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THRAP10827 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP10827 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP10827 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms