Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN1MW3P0DN78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms