Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM10L1P0DMW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM10L1P0DMW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms