Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCCAP05165 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCCAP05165 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCCAP05165 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCCAP05165 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCCAP05165 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCCAP05165 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCCAP05165 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCCAP05165 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCCAP05165 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCCAP05165 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCCAP05165 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCCAP05165 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCCAP05165 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCCAP05165 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCCAP05165 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCCAP05165 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCCAP05165 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCCAP05165 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCCAP05165 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCCAP05165 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCCAP05165 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCCAP05165 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCCAP05165 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCCAP05165 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCCAP05165 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCCAP05165 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCCAP05165 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms