Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGAP02671 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGAP02671 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FGAP02671 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGAP02671 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGAP02671 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGAP02671 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGAP02671 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGAP02671 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGAP02671 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGAP02671 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGAP02671 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGAP02671 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGAP02671 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGAP02671 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGAP02671 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGAP02671 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGAP02671 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGAP02671 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGAP02671 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGAP02671 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGAP02671 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGAP02671 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGAP02671 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms