Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F13A1P00488 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F13A1P00488 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F13A1P00488 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F13A1P00488 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F13A1P00488 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F13A1P00488 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F13A1P00488 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F13A1P00488 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F13A1P00488 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
F13A1P00488 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F13A1P00488 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F13A1P00488 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F13A1P00488 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
F13A1P00488 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F13A1P00488 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
F13A1P00488 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F13A1P00488 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F13A1P00488 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F13A1P00488 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F13A1P00488 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
F13A1P00488 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13A1P00488 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
F13A1P00488 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
F13A1P00488 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
F13A1P00488 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
F13A1P00488 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
F13A1P00488 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
F13A1P00488 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms