Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms