Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CILPO75339 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CILPO75339 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CILPO75339 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CILPO75339 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CILPO75339 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CILPO75339 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CILPO75339 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CILPO75339 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CILPO75339 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CILPO75339 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CILPO75339 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CILPO75339 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CILPO75339 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CILPO75339 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CILPO75339 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CILPO75339 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms