Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms