Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms