Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEFVO15553 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEFVO15553 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEFVO15553 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEFVO15553 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEFVO15553 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEFVO15553 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEFVO15553 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEFVO15553 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEFVO15553 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEFVO15553 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEFVO15553 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEFVO15553 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEFVO15553 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEFVO15553 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEFVO15553 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEFVO15553 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEFVO15553 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEFVO15553 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEFVO15553 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEFVO15553 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEFVO15553 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms