Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA5O15230 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA5O15230 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
LAMA5O15230 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms