Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQF6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQF6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A1W2PQF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQF6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms