Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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