Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms