Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms